Comment les interactions moléculaires peuvent être utilisées pour prédire la fonction d'un candidat pharmacologiquement actif ?
Le drug design va tenter d'utiliser les informations sur les interactions entre molécules et récepteurs pour optimiser l'usage de ces molécules candidates.
Parlons déjà du Docking
Dans l'industrie pharmaceutique, la prédiction via modélisation informatique est un grand domaine de la recherche. Eh oui ce n'est pas du tout propre aux dealers drug designer des RC.
Petite anecdote, savez-vous pourquoi nous ne faisons pas la synthèse totale de la morphine et pourquoi nous préférons la cultiver sur notre territoire ?
La synthèse totale la plus rentable comporte 22 étapes. C'est anti-économique et anti-écologique. Deux lignes directrices en chimie organique.
Docking
Le docking (ou "amarrage moléculaire") est une approche numérique de modélisation moléculaire. Elle cherche à identifier la meilleure orientation entre 2 molécules sur la base de leur coordonnées dans des états pris séparément.
Le principe du docking repose sur 3 étapes :
Représentation des systèmes moléculaires
Établissement d'un algorithme de recherche des interactions
Établissement d'une fonction permettant d'évaluer l'interaction entre les partenaires